- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- GISPA(开发版)
GISPA
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DOI:10.18129 / B9.bioc.GISPA
这是发展GISPA版本;稳定的发布版本,请参阅GISPA。
GISPA:基因集成组谱分析方法
Bioconductor版本:发展(3.17)
GISPA方法用于研究人员感兴趣的定义与类似的基因集,先天的指定分子概要文件。GISPA方法之前发表在核酸研究(Kowalski et al ., 2016;PMID: 26826710)。
作者:巴克提已经和珍妮·科瓦尔斯基
维护人员:巴克提已经<巴克提。德维威迪emory.edu >
从内部引用(R,回车引用(“GISPA”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“GISPA”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“GISPA”)
| HTML | R脚本 | GISPA:基因集成组谱分析方法 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | GeneSetEnrichment,GenomeWideAssociation,软件,StatisticalMethod |
| 版本 | 1.23.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.5 (r - 3.4)(5.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 3.5) |
| 进口 | Biobase,changepoint,data.table,genefilter、图形、GSEABase,HH,晶格,latticeExtra,plyr,scatterplot3d,统计数据 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | GISPA_1.23.0.tar.gz |
| Windows二进制 | GISPA_1.23.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | GISPA_1.23.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | GISPA_1.23.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GISPA |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GISPA |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/GISPA/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GISPA/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
