- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- GENIE3(开发版)
GENIE3
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DOI:10.18129 / B9.bioc.GENIE3
这是发展GENIE3版本;稳定的发布版本,请参阅GENIE3。
基因网络推理树的合奏
Bioconductor版本:发展(3.17)
这个包实现了GENIE3算法从表达数据推断基因调控网络。
作者:范·安Huynh-Thu Sara Aibar皮埃尔吉尔茨
维护人员:凡安Huynh-Thu < vahuynh在ulg.ac.be >
从内部引用(R,回车引用(“GENIE3”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“GENIE3”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“GENIE3”)
| HTML | R脚本 | GENIE3 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DecisionTree,GeneExpression,GraphAndNetwork,网络,NetworkInference,回归,软件,SystemsBiology |
| 版本 | 1.21.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | |
| 进口 | 统计数据,reshape2,dplyr |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,rmarkdown,foreach,doRNG,doParallel,Biobase,SummarizedExperiment,testthat、方法 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | BioNERO,MetNet |
| 建议我 | dnapath |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | GENIE3_1.21.0.tar.gz |
| Windows二进制 | GENIE3_1.21.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | GENIE3_1.21.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | GENIE3_1.21.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GENIE3 |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GENIE3 |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/GENIE3/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GENIE3/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
