宝石

DOI:10.18129 / B9.bioc.GEM

这是发展创业板版本;稳定版请参见宝石．

基因、环境和甲基化相互作用的快速关联研究

Bioconductor版本:开发(3.17)

广泛的EWAS、methQTL和GxE基因组分析工具。

作者:Hong Pan, Joanna D Holbrook, Neerja Karnani, Chee-Keong Kwoh

维护人员:潘红

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("GEM")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“宝石”)

超文本标记语言	R脚本	创业板用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNAMethylation，GUI，GeneExpression，GenomeWideAssociation，MethylSeq，MethylationArray，回归，单核苷酸多态性，软件
版本	1.25.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 3.3)
进口	tcltk,ggplot2，方法，统计，grDevices，图形，utils
链接
建议	knitr，RUnit，testthat，BiocGenerics，rmarkdown，减价
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	GEM_1.25.0.tar.gz
Windows二进制	GEM_1.25.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	GEM_1.25.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	GEM_1.25.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GEM
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GEM
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/GEM/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GEM/
软件包下载报告	下载数据