- 家
- Bioconductor 3.16
- 软件包
- GA4GHclient(开发版)
GA4GHclient
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.GA4GHclient
这是发展GA4GHclient版本;稳定的发布版本,请参阅GA4GHclient。
Bioconductor包访问GA4GH API数据服务器
Bioconductor版本:发展(3.16)
GA4GHclient提供了一种简便的方法来访问公共数据服务器通过基因组学和全球联盟卫生(GA4GH)基因组的API。它提供了低级访问GA4GH API和响应数据转换为Bioconductor-based类对象。
作者:Welliton Souza (aut (cre) Benilton卡瓦略(施),克莉斯婷罗查(施)
维护人员:Welliton Souza < well309 gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“GA4GHclient”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“GA4GHclient”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“GA4GHclient”)
| HTML | R脚本 | GA4GHclient |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DataRepresentation,软件,ThirdPartyClient |
| 版本 | 1.21.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.5 (r - 3.4)(5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | R (> = 3.5.0),S4Vectors |
| 进口 | BiocGenerics,Biostrings,dplyr,GenomeInfoDb,GenomicRanges,httr,IRanges,jsonlite、方法、VariantAnnotation |
| 链接 | |
| 建议 | AnnotationDbi,BiocStyle,DT,knitrorg.Hs.eg.db,rmarkdown,testthat,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/labbcb/GA4GHclient |
| BugReports | https://github.com/labbcb/GA4GHclient/issues |
| 取决于我 | GA4GHshiny |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | GA4GHclient_1.21.0.tar.gz |
| Windows二进制 | GA4GHclient_1.21.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | GA4GHclient_1.21.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GA4GHclient |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GA4GHclient |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GA4GHclient/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
