Filterffpe
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doi：10.18129/b9.bioc.filterffpe
这是发展版本的FelterFfpe;对于稳定版本，请参阅Filterffpe。
FFPE人工嵌合读取过滤器NGS数据
生物导体版本：开发（3.16）
该软件包找到并过滤了福尔马林固定石蜡包裹（FFPE）组织的下一代测序（NGS）过程中专门生成的人工嵌合读取。这些人工嵌合读数可以导致大量的假阳性结构变化（SV）调用。所需的输入是FFPE样本的索引BAM文件。
作者：Lanying Wei [AUT，CRE]
维护者：lanying wei
引用（从r内，输入引用（“ filterffpe”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：
if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ filterfffpe”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ filterffpe”）
| R脚本 | Filtfpe的简介 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 结盟，，，，预处理，，，，QualityControl，，，，测序，，，，软件，，，，结构变化 |
| 版本 | 1.7.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.12（R-4.0）（2年） |
| 执照 | LGPL-3 |
| 要看 | |
| 进口 | foreach，，，，多帕尔，，，，基因组机，，，，iranges，，，，rsamtools， 平行，S4VECTORS |
| 链接 | |
| 建议 | 生物使用 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | Filterffpe_1.7.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Filterffpe_1.7.0.zip（仅64位） |
| MacOS 10.13（高山脉） | Filterffpe_1.7.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/filterffpe |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/filterffpe |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/filterffpe/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
