表达

doi：10.18129/b9.bioc.expressionatlas

这是发展ExpressionAtlas的版本；对于稳定版本，请参阅表达。

从embl-ebi表达图集下载数据集

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包用于在EMBL-EBI表达地图集中搜索数据集，并将其下载到R中以进行进一步分析。每个表达式图集数据集被表示为一个简单对象，每个平台一个元素。测序数据包含在摘要的特性对象中，而微阵列数据包含在表达式集或Malist对象中。

作者：玛丽亚·基斯（Maria Keays）

维护者：ebi.ac.uk> pedro madrigal <基因表达>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version ='devel'）biocmanager :: install（“ ExpressionAtAtlas”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“表达式”）

html	R脚本	表达
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	ArrayExpress，，，，实验数据，，，，表达数据，，，，微阵列，，，，序列数据，，，，软件
版本	1.25.5
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（6。5年）
执照	GPL（> = 3）
要看	R（> = 4.2.0），方法，生物酶，，，，总结性特征，，，，林玛，，，，S4VECTORS，，，，XML2，，，，rcurl
进口	utils，XML，，，，httr
链接
建议	尼特，，，，测试，，，，rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我	空间Heatmap
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	expressionAtlas_1.25.5.5.tar.gz
Windows二进制	expressionAtlas_1.25.5.5.zip
MacOS 10.13（高山脉）	ExpressionAtlas_1.25.5.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/expressionatlas
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/expressiveatlas
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/expressionatlas/
软件包下载报告	下载统计