ExperimentSubset

DOI:10.18129 / B9.bioc.ExperimentSubset

这是发展ExperimentSubset版本;稳定的发布版本,请参阅ExperimentSubset。

管理与Bioconductor实验对象的数据子集

Bioconductor版本:发展(3.17)

实验对象如SummarizedExperiment或SingleCellExperiment为一个或多个矩阵像化验数据容器及其相关的行和列的数据。通常只有一个子集的原始数据需要加分析。例如,过滤质量差样品前需要排除一些列分析。ExperimentSubset对象是一个容器来有效地管理不同子集的相同的数据,而不必为每个新子集使单独的对象。

作者:Irzam Sarfraz (aut (cre)黑色,穆罕默德阿西夫(aut)约书亚·d·坎贝尔(aut)

维护人员:Irzam Sarfraz < irzam9095 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“ExperimentSubset”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“ExperimentSubset”)

HTML	R脚本	介绍ExperimentSubset类
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataImport,DataRepresentation,基础设施,软件
版本	1.9.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(2年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 4.0.0),SummarizedExperiment,SingleCellExperiment,SpatialExperiment,TreeSummarizedExperiment
进口	方法,矩阵,S4Vectors
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,covr统计数据,食物,嘘,scds,TENxPBMCData,气道
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ExperimentSubset_1.9.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)	ExperimentSubset_1.9.0.tgz
macOS二进制(arm64)	ExperimentSubset_1.9.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExperimentSubset
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ExperimentSubset
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ExperimentSubset/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ExperimentSubset/
包下载报告	下载数据