这是发展ExperimentSubset版本;稳定的发布版本,请参阅ExperimentSubset。
Bioconductor版本:发展(3.17)
实验对象如SummarizedExperiment或SingleCellExperiment为一个或多个矩阵像化验数据容器及其相关的行和列的数据。通常只有一个子集的原始数据需要加分析。例如,过滤质量差样品前需要排除一些列分析。ExperimentSubset对象是一个容器来有效地管理不同子集的相同的数据,而不必为每个新子集使单独的对象。
作者:Irzam Sarfraz (aut (cre)黑色,穆罕默德阿西夫(aut)
约书亚·d·坎贝尔(aut)
维护人员:Irzam Sarfraz < irzam9095 gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“ExperimentSubset”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“ExperimentSubset”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ExperimentSubset”)
HTML | R脚本 | 介绍ExperimentSubset类 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | DataImport,DataRepresentation,基础设施,软件 |
版本 | 1.9.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.12 (r - 4.0)(2年) |
许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
取决于 | R (> = 4.0.0),SummarizedExperiment,SingleCellExperiment,SpatialExperiment,TreeSummarizedExperiment |
进口 | 方法,矩阵,S4Vectors |
链接 | |
建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,covr统计数据,食物,嘘,scds,TENxPBMCData,气道 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | ExperimentSubset_1.9.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS二进制(x86_64) | ExperimentSubset_1.9.0.tgz |
macOS二进制(arm64) | ExperimentSubset_1.9.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExperimentSubset |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ExperimentSubset |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/ExperimentSubset/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ExperimentSubset/ |
包下载报告 | 下载数据 |