EPITXDB.

DOI：10.18129 / b9.bioc.epitxdb.

这是发展epitxdb的版本;对于稳定的版本版本，请参阅EPITXDB.。

使用AnnotationDBI接口存储和访问ePITRASTFARMOMIC信息

Bioconducts版本：开发（3.14）

EPITXDB促进eATRASTFRIPMIC信息的存储。更具体地，它可以跟踪修改身份，位置，用于将其引入RNA上的酶，确定要修改RNA上的位置的说明符，并且每个修改的文献参考相关。

作者：Felix上午ernst [aut，cre]

维护者：Felix上午ernst

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！qualocmanage（“biocmanager”，squally = true））install.packages（“biocmanager”）＃以下初始化Buoc Devel Biocmanager :: Install（版本='devel'）BiocManager ::安装（“epitxdb”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“EPITXDB”）

HTML.	r script.	EPITXDB.
HTML.	r script.	EPITXDB创作
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	epitranscriptomics.那软件
版本	1.5.0.
在生物导体中以来	BIOC 3.11（R-4.0）（1年）
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 4.0），annotationdbi.那modstrings.
进口	方法，Utils，httr.那XML2.那卷曲那基因组法那Genomicranges.那Genomeinfodb.那生物根系那biocfilecache.那S4Vectors.那绞喉那rsqlite.那DBI.那生物仪器那trnadbimport.
链接到
建议	生物焦那kn那RAMAMAMDOW.那testthat.那哈特斯特那annotationhub.那Ensembldb.那ggplot2.，epitxdb.hs.hg38，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38，bsgenome.scerevisiae.ucsc.saccer3，txdb.hsapiens.ucsc.hg38.knowngene
系统要求
加强
URL.	https://github.com/felixernster/epitxdb.
Bugreports.	https://github.com/felixernster/epitxdb/issues.
取决于我	epitxdb.hs.hg38，epitxdb.mm.mm10，epitxdb.sc.saccer3
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	epitxdb_1.5.0.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13（高塞拉）	epitxdb_1.5.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/epitxdb.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocumon.org：包/ epitxdb
包短网址	https://biocumon.org/packages/epitxdb/
包裹下载报告	下载统计信息