富集图

doi：10.18129/b9.bioc.enrichedheatmap

这是发展版本的RenicheDheatMap;对于稳定版本，请参阅富集图。

制作丰富的热图

生物导体版本：开发（3.16）

富集的热图是一种特殊的热图，可视化基因组信号在特定目标区域的富集。在这里，我们通过ComplexHeatMap软件包实现了丰富的热图。由于这种类型的热图只是一个普通的热图，但是在某些特殊设置的情况下，具有复杂Heatmap的功能，因此自定义热图并将其串联到热图列表中以显示不同数据源之间的对应性要容易得多。

作者：Zuguang Gu [AUT，CRE]

维护者：Zuguang gu

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ enricheDheatHeatMap”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“富集”示意图）

html	R脚本	1.制作丰富的热图
html	R脚本	2.可视化分类信号
html	R脚本	3.比较行排序方法
html	R脚本	4.可视化路线图数据集中的全面关联
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	覆盖范围，，，，基因数，，，，测序，，，，软件，，，，可视化
版本	1.27.0
在生物导体中	Bioc 3.2（R-3.2）（6。5年）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	R（> = 3.6.0），方法，网格，复杂的图像（> = 2.11.0），基因组机
进口	矩阵，统计getoptlong，，，，RCPP，utils，Locfit，，，，循环（> = 0.4.5），iranges
链接	RCPP
建议	测试（> = 0.3），尼特，，，，降价，，，，rmarkDown，，，，GeneFilter，，，，rcolorbrewer
系统要求
增强
URL	https://github.com/jokergoo/enrichedheatmap
取决于我
进口我	伸出，，，，profileplyr
建议我	复杂的图像，，，，Epistack，，，，Interactivecomplexheatmap
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	enricheDheatMap_1.27.0.tar.gz
Windows二进制	enricheDheatMap_1.27.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	enricheDheatMap_1.27.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/enrichedheatmap
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/ronicheDheatMap
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/enrichedheatmap/
软件包下载报告	下载统计