EnMCB

DOI:10.18129 / B9.bioc.EnMCB

这是发展EnMCB版本;稳定的发布版本,请参阅EnMCB

基于甲基化预测疾病进展相关的块使用整体模型

Bioconductor版本:发展(3.17)

创建使用DNA甲基化概要文件相关的块。机器学习模型可以预测不同甲基化构造块和疾病进展。

作者:鑫玉

维护人员:Xin Yu < whirlsyu gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“EnMCB”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“EnMCB”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

PDF 参考手册

细节

biocViews DNAMethylation,MethylationArray,归一化,软件,SupportVectorMachine
版本 1.11.1
Bioconductor自 BioC 3.11 (r - 4.0)(2.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (> = 4.0)
进口 方法、统计数据survivalROC,glmnet,rms,mboost,矩阵,igraph,survivalsvm,ggplot2,BiocFileCache,引导,e1071,生存,跑龙套
链接
建议 SummarizedExperiment,testthat,Biobase,survminer,affycoretools,knitr,plotROC,minfi,limma,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/whirlsyu/EnMCB/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包
Windows二进制 EnMCB_1.11.1.zip
macOS二进制(x86_64) EnMCB_1.11.1.tgz
macOS二进制(arm64) EnMCB_1.11.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EnMCB
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ EnMCB
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/EnMCB/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/EnMCB/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
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