EmpiricalBrownsMethod

DOI:10.18129 / B9.bioc.EmpiricalBrownsMethod

这是发展经验布朗方法;稳定版请参见EmpiricalBrownsMethod．

使用布朗的方法组合来自相关测试的p值

Bioconductor版本:开发(3.17)

结合多个统计测试的p值在生物信息学中很常见。然而，对于相关的p值，这个过程并不简单。该软件包实现了Brown方法(Fisher方法的扩展)的经验适应，用于组合相关p值，适用于高通量生物实验中发现的高度相关数据集。

作者:威廉·普尔

维护者:David Gibbs

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("EmpiricalBrownsMethod")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“EmpiricalBrownsMethod”)

超文本标记语言	R脚本	经验布朗方法
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	GeneExpression，通路，软件，StatisticalMethod
版本	1.27.0
在Bioconductor	BioC 3.3 (R-3.3)(7年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	R (>= 3.2.0)
进口
链接
建议	BiocStyle，testthat，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/IlyaLab/CombiningDependentPvaluesUsingEBM.git
全靠我	poolVIM
进口我	EBSEA，NADfinder
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	EmpiricalBrownsMethod_1.27.0.tar.gz
Windows二进制	EmpiricalBrownsMethod_1.27.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	EmpiricalBrownsMethod_1.27.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	EmpiricalBrownsMethod_1.27.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EmpiricalBrownsMethod
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/EmpiricalBrownsMethod
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/EmpiricalBrownsMethod/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/EmpiricalBrownsMethod/
软件包下载报告	下载数据