ERSSA

DOI:10.18129 / B9.bioc.ERSSA

这是发展ersa版本;稳定版请参见ERSSA．

经验RNA-seq样本量分析

Bioconductor版本:开发(3.17)

ersa包获取用户提供的RNA-seq差异表达数据集，并计算不同生物复制水平下差异表达基因的数量。这允许用户在不依赖任何先验假设的情况下，确定他们的RNA-seq数据集是否已经实现了足够的差异检测。

作者:邵子轩[aut, cre]

维护者:Zixuan Shao

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install(" ersa ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ERSSA”)

超文本标记语言	R脚本	ersa包简介
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，ImmunoOncology，MultipleComparison，质量控制，RNASeq，软件，转录
版本	1.17.0
在Bioconductor	BioC 3.8 (R-3.5)(4年)
许可证	GPL-3 |文件许可证
取决于	R (>= 4.0.0)
进口	刨边机(> = 3.23.3),DESeq2(> = 1.21.16),ggplot2(> = 3.0.0),RColorBrewer(> = 1.1 2),plyr(> = 1.8.4),BiocParallel(>= 1.15.8)， grDevices, stats, utils
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/zshao1/ERSSA
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ERSSA_1.17.0.tar.gz
Windows二进制	ERSSA_1.17.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	ERSSA_1.17.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	ERSSA_1.17.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ERSSA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ ersa
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ERSSA/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ERSSA/
软件包下载报告	下载数据