ERSSA

DOI:10.18129 / B9.bioc.ERSSA

这是发展ersa版本;稳定版请参见ERSSA

经验RNA-seq样本量分析

Bioconductor版本:开发(3.17)

ersa包获取用户提供的RNA-seq差异表达数据集,并计算不同生物复制水平下差异表达基因的数量。这允许用户在不依赖任何先验假设的情况下,确定他们的RNA-seq数据集是否已经实现了足够的差异检测。

作者:邵子轩[aut, cre]

维护者:Zixuan Shao

引文(从R内,输入引用(“ERSSA”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install(" ersa ")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ERSSA”)

超文本标记语言 R脚本 ersa包简介
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews DifferentialExpressionGeneExpressionImmunoOncologyMultipleComparison质量控制RNASeq软件转录
版本 1.17.0
在Bioconductor BioC 3.8 (R-3.5)(4年)
许可证 GPL-3 |文件许可证
取决于 R (>= 4.0.0)
进口 刨边机(> = 3.23.3),DESeq2(> = 1.21.16),ggplot2(> = 3.0.0),RColorBrewer(> = 1.1 2),plyr(> = 1.8.4),BiocParallel(>= 1.15.8), grDevices, stats, utils
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/zshao1/ERSSA
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 ERSSA_1.17.0.tar.gz
Windows二进制 ERSSA_1.17.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) ERSSA_1.17.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) ERSSA_1.17.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ERSSA
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ ersa
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ERSSA/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ERSSA/
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