ENmix

DOI:10.18129 / B9.bioc.ENmix

这是发展ENmix版本;稳定的发布版本,请参阅ENmix

质量控制和分析工具Illumina公司DNA甲基化BeadChip

Bioconductor版本:发展(3.16)

质量控制工具,分析和visulization Illumina公司DNA甲基化的数组。

作者:Zongli徐(cre, aut),梁妞妞(aut)杰克•泰勒(施)

维护人员:徐Zongli < xuz在niehs.nih.gov >

从内部引用(R,回车引用(“ENmix”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“ENmix”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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PDF R脚本 ENmix用户指南
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews BatchEffect,DNAMethylation,DataImport,DifferentialMethylation,表观遗传学,ImmunoOncology,MethylationArray,微阵列,多通道,归一化,OneChannel,预处理,PrincipalComponent,质量控制,回归,软件,TwoChannel
版本 1.33.0
Bioconductor自 BioC 3.1 (r - 3.2)(7.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R(> = 3.5.0),并行,doParallel,foreach,SummarizedExperiment,统计数据
进口 grDevices、图形preprocessCore,matrixStats、方法、跑龙套geneplotter,嫁祸于,minfi,RPMM,illuminaio,dynamicTreeCut,IRanges,gtools,Biobase,ExperimentHub,AnnotationHub,genefilter,gplots,quadprog,S4Vectors
链接
建议 minfiData,RUnit,BiocGenerics
SystemRequirements
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 ENmix_1.33.0.tar.gz
Windows二进制 ENmix_1.33.0.zip
macOS 10.13(高山脉) ENmix_1.33.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ENmix
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ENmix
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ENmix/
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