EBImage

DOI:10.18129 / B9.bioc.EBImage

这是发展EBImage版本;稳定的发布版本请参见EBImage。

图像处理和分析工具箱的R

生物导体版本:开发(3.13)

EBImage提供了用于图像处理和分析的通用功能。在(高通量)基于显微镜的细胞分析中，EBImage提供了分割细胞和提取定量细胞描述符的工具。这允许使用R编程语言自动化此类任务，并促进R环境中其他工具的使用，如信号处理、统计建模、机器学习和图像数据可视化。

作者:Andrzej Oleś， Gregoire Pau, Mike Smith, Oleg Sklyar, Wolfgang Huber，由Joseph Barry和Philip A. Marais贡献

维护者:Andrzej Oleś < Andrzej。ole gmail.com >

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("EBImage")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放。

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“EBImage”)

超文本标记语言	R脚本	介绍EBImage
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	软件,可视化
版本	4.33.0
Bioconductor自	BioC 1.8 (R-2.3)(15年)
许可证	LGPL
取决于	方法
进口	BiocGenerics(>= 0.7.1)、graphics、grDevices、stats、abind,tiff,jpeg,png,locfit,fftwtools7(> = 0.9),跑龙套,htmltools,htmlwidgets,RCurl
链接
建议	BiocStyle,消化,knitr,rmarkdown,闪亮的
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/aoles/EBImage
BugReports	https://github.com/aoles/EBImage/issues
取决于我	红衣主教,CRImage,cytomapper,DonaPLLP2013,FISHalyseR,flowcatchR,furrowSeg,HD2013SGI,imageHTS
进口我	bnbc,承认,flowCHIC,的热图,寄居,山药
建议我	DmelSGI,HilbertVis,tofsims
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包	EBImage_4.33.0.tar.gz
Windows二进制	EBImage_4.33.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	EBImage_4.33.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EBImage
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ EBImage
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/EBImage/
包下载报告	下载数据