沙丘

doi:10.18129/b9.bioc.dune

这是发展沙丘的版本;对于稳定版本,请参阅沙丘

改善单细胞RNA-seq细胞类型发现中的可复制性

生物导体版本:开发(3.16)

给定一组聚类标签,沙丘合并了成对的簇,以增加标签之间的平均ARI,从而提高可复制性。

作者:Hector Roux de Bezieux [AUT,CRE],凯利街[aut]

维护者:hector roux de bezieux

引用(从r内,输入引用(“沙丘”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ Dune”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“沙丘”)

html R脚本 沙丘小插图
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 聚类,,,,基因表达,,,,rnaseq,,,,Singlecell,,,,软件,,,,转录组学,,,,可视化
版本 1.9.0
在生物导体中 Bioc 3.11(R-4.0)(2年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 R(> = 3.6)
进口 生物比较,,,,总结性特征,utils,GGPLOT2,,,,dplyr,,,,花花公子,,,,rcolorbrewer,,,,马格里特,,,,gganimate,,,,purrr,,,,Aricode
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试(> = 2.1.0)
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Dune_1.9.0.tar.gz
Windows二进制 Dune_1.9.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Dune_1.9.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dune
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/沙丘
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/dune/
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