这是发展Doscheda版本;稳定的发布版本,请参阅Doscheda。
Bioconductor版本:发展(3.18)
Doscheda侧重于定量chemoproteomics用于确定蛋白相互作用的小分子从整个细胞或组织溶解产物使用质谱数据。包提供了一个闪亮的应用程序运行的管道,几可视图和一个可下载的实验报告。
作者:Bruno Contrino皮耶罗Ricchiuto
维护人员:布鲁诺Contrino < br1contrino在yahoo.co.uk >
从内部引用(R,回车引用(“Doscheda”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“Doscheda”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
参考手册 |
biocViews | DataImport,MassSpectrometry,归一化,预处理,蛋白质组学,质量控制,回归,软件 |
版本 | 1.23.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(5.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (> = 3.4) |
进口 | 方法、刚果民主共和国、统计、httr jsonlite, reshape2,vsn,affy,limmastringr ggplot2,图形、grDevices校准,corrgram, gridExtra, DT,闪亮,shinydashboard, readxl, prodlim matrixStats |
链接 | |
建议 | BiocStyle,rmarkdown knitr testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | |
Windows二进制 | Doscheda_1.23.0.zip |
macOS二进制(x86_64) | |
macOS二进制(arm64) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Doscheda |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Doscheda |
Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/Doscheda/ |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Doscheda/ |
包下载报告 | 下载数据 |