这是发展Dirichletmultinomial的版本;对于稳定版本,请参阅dirichletmultinomial。
生物导体版本:开发(3.16)
Dirichlet-Multinomial混合模型可用于描述微生物宏基因组数据中的变异性。该软件包是最初由Holmes,Harris和Quince提供的代码的接口,2012年,PLOS ONE 7(2):1-15,如该软件包的“ MAN”页面中进一步讨论,?
作者:Martin Morgan
维护者:Martin Morgan
引用(从r内,输入引用(“ dirichletmultinomial”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ dirichletmultinomial”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ dirichletmultinomial”)
R脚本 | Dirichletmultinolial的简介 | |
参考手册 |
生物浏览 | 分类,,,,聚类,,,,免疫学,,,,宏基因组学,,,,微生物组,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.39.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.11(R-2.15)(10年) |
执照 | LGPL-3 |
要看 | S4VECTORS,,,,iranges |
进口 | Stats4,方法,生物基因 |
链接 | |
建议 | 格子, 平行,大量的,,,,rcolorbrewer,,,,Xtable |
系统要求 | GSL |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | 米娅,,,,迈维兹,,,,TFBSTOOLS |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | dirichletmultinomial_1.39.0.tar.gz |
Windows二进制 | dirichletmultinomial_1.39.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | dirichletmultinomial_1.39.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dirichletmultinomial |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/dirichletmultinomial |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/dirichletmultinomial/ |
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