dirichletmultinomial

doi:10.18129/b9.bioc.dirichletmultinomial

这是发展Dirichletmultinomial的版本;对于稳定版本,请参阅dirichletmultinomial

Dirichlet-Multinomial混合模型机器学习微生物组数据

生物导体版本:开发(3.16)

Dirichlet-Multinomial混合模型可用于描述微生物宏基因组数据中的变异性。该软件包是最初由Holmes,Harris和Quince提供的代码的接口,2012年,PLOS ONE 7(2):1-15,如该软件包的“ MAN”页面中进一步讨论,?

作者:Martin Morgan

维护者:Martin Morgan

引用(从r内,输入引用(“ dirichletmultinomial”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ dirichletmultinomial”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ dirichletmultinomial”)

PDF R脚本 Dirichletmultinolial的简介
PDF 参考手册

细节

生物浏览 分类,,,,聚类,,,,免疫学,,,,宏基因组学,,,,微生物组,,,,测序,,,,软件
版本 1.39.0
在生物导体中 Bioc 2.11(R-2.15)(10年)
执照 LGPL-3
要看 S4VECTORS,,,,iranges
进口 Stats4,方法,生物基因
链接
建议 格子, 平行,大量的,,,,rcolorbrewer,,,,Xtable
系统要求 GSL
增强
URL
取决于我
进口我 米娅,,,,迈维兹,,,,TFBSTOOLS
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 dirichletmultinomial_1.39.0.tar.gz
Windows二进制 dirichletmultinomial_1.39.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) dirichletmultinomial_1.39.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dirichletmultinomial
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/dirichletmultinomial
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/dirichletmultinomial/
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