DiffLogo

DOI:10.18129 / B9.bioc.DiffLogo

这是发展DiffLogo版本;稳定的发布版本,请参阅DiffLogo。

DiffLogo:比较biooligomer图案的可视化

Bioconductor版本:发展(3.16)

DiffLogo是一个易于使用的工具来可视化主题差异。

作者:c(人(“马丁”、“荨麻”,角色= c (“aut”、“中铁快运”),电子邮件=“martin.nettling@informatik.uni-halle.de”)、人(“•”、“Treutler”,角色= c (“aut”、“中铁快运”),电子邮件=“hendrik.treutler@ipb-halle.de”)、人(“简”,“格劳”,角色= c (“aut”,“施”),电子邮件=“grau@informatik.uni-halle.de”)、人(“安德鲁”,“兰多”,角色= c (“aut”,“施”),电子邮件=“dronte@autosome.ru”)、人(“Jens”、“Keilwagen”,角色= c (“aut”,“施”),电子邮件=“jens.keilwagen@julius-kuehn.de”)、人(Stefan”、“Posch”=“aut”作用,电子邮件=“posch@informatik.uni-halle.de”)、人(“伊”、“Grosse”=“aut”作用,电子邮件=“grosse@informatik.uni-halle.de”))

亨德里克•Treutler维护者:<•。在gmail.com treutler >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“DiffLogo”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“DiffLogo”)

PDF	R脚本	DiffLogo包的基础
PDF		参考手册

细节

biocViews	对齐,MotifAnnotation,MultipleComparison,SequenceMatching,软件,可视化
版本	2.21.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(6.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> = 3.4),统计数据,cba
进口	grDevices、图形、跑龙套、工具
链接
建议	knitr,testthat,seqLogo,MotifDb
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/mgledi/DiffLogo/
BugReports	https://github.com/mgledi/DiffLogo/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	DiffLogo_2.21.0.tar.gz
Windows二进制	DiffLogo_2.21.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	DiffLogo_2.21.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DiffLogo
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DiffLogo
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DiffLogo/
包下载报告	下载数据