这是发展版本的delaymatrixstats;对于稳定版本,请参阅延迟的matrixstats。
生物导体版本:开发(3.16)
从“ delayedArray”软件包中使用的“ matrixstats” API的端口可与delayedmatrix对象一起使用。高性能功能在行和延迟对象的列上运行,例如col / rowmedians(),col / rowranks()和col / rowsds()。每个数据类型和子集计算优化的函数,使内存使用和处理时间均可最大程度地减少。
作者:Peter Hickey [Aut,Cre],HervéPagès[CTB],Aaron Lun [CTB]
维护者:彼得·希基(Peter Hickey)
引用(从r内,输入引用(“ delaymatrixstats”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ delaysedmatrixstats”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ delaymatrixstats”)
html | R脚本 | 延迟matrixstats的概述 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | datarepresentation,,,,基础设施,,,,软件 |
版本 | 1.19.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.6(R-3.4)(4。5年) |
执照 | 麻省理工学院 +文件执照 |
要看 | 矩阵(> = 1.5.3),延迟(> = 0.17.6) |
进口 | 方法,矩阵(> = 0.60.0),Sparsematrixstats,,,,矩阵,,,,S4VECTORS(> = 0.17.5),iranges(> = 2.25.10) |
链接 | |
建议 | 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,COVR,,,,生物使用,,,,微实验,,,,Profmem,,,,HDF5Array |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/petehaitch/delayedmatrixstats |
BugReports | https://github.com/petehaitch/delayedmatrixstats/issues |
取决于我 | |
进口我 | Aucell,,,,Batchelor,,,,饼干,,,,BSSEQ,,,,卡格,,,,CellDex,,,,CEPO,,,,carpartmap,,,,DMRSEQ,,,,液滴,,,,弗雷泽,,,,Glmgampoi,,,,GSVA,,,,Methrix,,,,甲基化,,,,米娅,,,,Minfi,,,,mumosa,,,,nxtirfcore,,,,PCATOOLS,,,,Scarray,,,,评分,,,,Scmerge,,,,斯克兰,,,,砍伐,,,,Singlecelltk,,,,辛格,,,,麻雀,,,,Weitrix |
建议我 | 延迟,,,,ewce,,,,矩阵,,,,mbkmeans,,,,SCPCA,,,,弹弓,,,,轨迹 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | delaymatrixstats_1.19.0.tar.gz |
Windows二进制 | delaymatrixstats_1.19.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | delaymatrixstats_1.19.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/delayedmatrixstats |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/delaymatrixstats |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/delayedmatrixstats/ |
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