延迟的matrixstats

doi:10.18129/b9.bioc.delayedmatrixstats

这是发展版本的delaymatrixstats;对于稳定版本,请参阅延迟的matrixstats

适用于“ delaymatrix”对象的行和列的函数

生物导体版本:开发(3.16)

从“ delayedArray”软件包中使用的“ matrixstats” API的端口可与delayedmatrix对象一起使用。高性能功能在行和延迟对象的列上运行,例如col / rowmedians(),col / rowranks()和col / rowsds()。每个数据类型和子集计算优化的函数,使内存使用和处理时间均可最大程度地减少。

作者:Peter Hickey [Aut,Cre],HervéPagès[CTB],Aaron Lun [CTB]

维护者:彼得·希基(Peter Hickey)

引用(从r内,输入引用(“ delaymatrixstats”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化了Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ delaysedmatrixstats”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ delaymatrixstats”)

html R脚本 延迟matrixstats的概述
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 datarepresentation,,,,基础设施,,,,软件
版本 1.19.0
在生物导体中 Bioc 3.6(R-3.4)(4。5年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 矩阵(> = 1.5.3),延迟(> = 0.17.6)
进口 方法,矩阵(> = 0.60.0),Sparsematrixstats,,,,矩阵,,,,S4VECTORS(> = 0.17.5),iranges(> = 2.25.10)
链接
建议 测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,COVR,,,,生物使用,,,,微实验,,,,Profmem,,,,HDF5Array
系统要求
增强
URL https://github.com/petehaitch/delayedmatrixstats
BugReports https://github.com/petehaitch/delayedmatrixstats/issues
取决于我
进口我 Aucell,,,,Batchelor,,,,饼干,,,,BSSEQ,,,,卡格,,,,CellDex,,,,CEPO,,,,carpartmap,,,,DMRSEQ,,,,液滴,,,,弗雷泽,,,,Glmgampoi,,,,GSVA,,,,Methrix,,,,甲基化,,,,米娅,,,,Minfi,,,,mumosa,,,,nxtirfcore,,,,PCATOOLS,,,,Scarray,,,,评分,,,,Scmerge,,,,斯克兰,,,,砍伐,,,,Singlecelltk,,,,辛格,,,,麻雀,,,,Weitrix
建议我 延迟,,,,ewce,,,,矩阵,,,,mbkmeans,,,,SCPCA,,,,弹弓,,,,轨迹
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 delaymatrixstats_1.19.0.tar.gz
Windows二进制 delaymatrixstats_1.19.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) delaymatrixstats_1.19.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/delayedmatrixstats
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/delaymatrixstats
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/delayedmatrixstats/
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