degnorm

doi:10.18129/b9.bioc.degnorm

这是发展Degnorm的版本;对于稳定版本,请参阅degnorm

DEGNORM:RNA-SEQ数据的降解归一化

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包在大量RNA-Seq数据中执行降解归一化,以提高差异表达分析精度。

作者:bin xiong和ji-ping王

维护者:北西北的Ji-ping wang

引用(从r内,输入引用(“ Degnorm”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ degnorm”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Degnorm”)

html R脚本 degnorm
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 结盟,,,,批处理效应,,,,覆盖范围,,,,DataImport,,,,差异性,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,正常化,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件
版本 1.7.0
在生物导体中 Bioc 3.12(R-4.0)(1。5年)
执照 LGPL(> = 3)
要看 R(> = 4.0.0),方法
进口 RCPP(> = 1.0.2),GenomicFeatures, 平行,foreach,,,,S4VECTORS,,,,多帕尔,,,,rsamtools(> = 1.31.2),基因组签名,,,,热图,,,,Data.Table,统计GGPLOT2,,,,基因组机,,,,iranges,,,,plyr,,,,情节,utils,维里迪斯
链接 RCPP,,,,rcpparmadillo,,,,S4VECTORS,,,,iranges
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,格式
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/jipingw/degnorm/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 degnorm_1.7.0.tar.gz
Windows二进制 degnorm_1.7.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) degnorm_1.7.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/degnorm
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/degnorm
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/degnorm/
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