这是发展Degnorm的版本;对于稳定版本,请参阅degnorm。
生物导体版本:开发(3.16)
该软件包在大量RNA-Seq数据中执行降解归一化,以提高差异表达分析精度。
作者:bin xiong和ji-ping王
维护者:北西北的Ji-ping wang
引用(从r内,输入引用(“ Degnorm”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(decon ='devel')biocmanager :: install(“ degnorm”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Degnorm”)
html | R脚本 | degnorm |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 结盟,,,,批处理效应,,,,覆盖范围,,,,DataImport,,,,差异性,,,,基因表达,,,,免疫学,,,,正常化,,,,QualityControl,,,,rnaseq,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.7.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.12(R-4.0)(1。5年) |
执照 | LGPL(> = 3) |
要看 | R(> = 4.0.0),方法 |
进口 | RCPP(> = 1.0.2),GenomicFeatures, 平行,foreach,,,,S4VECTORS,,,,多帕尔,,,,rsamtools(> = 1.31.2),基因组签名,,,,热图,,,,Data.Table,统计GGPLOT2,,,,基因组机,,,,iranges,,,,plyr,,,,情节,utils,维里迪斯 |
链接 | RCPP,,,,rcpparmadillo,,,,S4VECTORS,,,,iranges |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,格式 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/jipingw/degnorm/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | degnorm_1.7.0.tar.gz |
Windows二进制 | degnorm_1.7.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | degnorm_1.7.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/degnorm |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/degnorm |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/degnorm/ |
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