- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- 位深蓝(开发版)
位深蓝
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI:10.18129 / B9.bioc.DeepBlueR
这是发展版位深蓝;稳定的发布版本,请参阅位深蓝。
位深蓝
Bioconductor版本:发展(3.17)
通过R位深蓝表观遗传学数据服务器访问。
作者:费利佩·阿尔布雷特,马库斯列表
维护人员:菲利普阿尔布雷特<费利佩。albrecht mpi-inf.mpg.de >, <马库斯·马库斯列表。列表在tum.de >,佼佼者Quirin Manz < Quirin。在tum.de manz >
从内部引用(R,回车引用(“位深蓝”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“位深蓝”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“位深蓝”)
| HTML | R脚本 | 位深蓝外遗传性数据服务器- R包 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 注释,CpGIsland,DNAMethylation,DataImport,DataRepresentation,表观遗传学,GeneRegulation,GenomeAnnotation,ImmunoOncology,预处理,软件,ThirdPartyClient |
| 版本 | 1.25.1 |
| Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(6.5年) |
| 许可证 | GPL (> = 2.0) |
| 取决于 | R (> = 3.3),XML,RCurl |
| 进口 | GenomicRanges,data.table,stringr,diffr,dplyr、方法、rjson跑龙套,R.utils,foreach,withr,rtracklayer,GenomeInfoDb,设置,filehash |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,rmarkdown,萝拉,Gviz,gplots,ggplot2,tidyr,RColorBrewer,matrixStats |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | DeepBlueR_1.25.1.tar.gz |
| Windows二进制 | DeepBlueR_1.25.1.zip |
| macOS二进制(x86_64) | DeepBlueR_1.25.1.tgz |
| macOS二进制(arm64) | DeepBlueR_1.25.1.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DeepBlueR |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/位深蓝 |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/DeepBlueR/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DeepBlueR/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
