DeconRNASeq

DOI:10.18129 / B9.bioc.DeconRNASeq

这是发展DeconRNASeq的版本;稳定版请参见DeconRNASeq．

用于mRNA-Seq数据的异构组织样本反褶积

Bioconductor版本:开发(3.17)

DeconSeq是一个R包，用于基于mRNA-Seq数据对异质组织进行反褶积。它将mRNA-Seq中来自异质细胞群的表达水平建模为来自不同构成细胞类型的表达的加权平均值，并预测单个表达谱的细胞类型比例。

作者:tinggong Joseph D. Szustakowski < Joseph。Szustakowski在novarti.com >上报道

维护人员:Ting Gong

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("DeconRNASeq")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“DeconRNASeq”)

PDF	R脚本	DeconRNASeq演示
PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression，软件
版本	1.41.0
在Bioconductor	BioC 2.11 (R-2.15)(10.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 2.14.0)，limSolve，pcaMethods，ggplot2、网格
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我	适应
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	DeconRNASeq_1.41.0.tar.gz
Windows二进制	DeconRNASeq_1.41.0.zip(64位)
macOS二进制文件(x86_64)	DeconRNASeq_1.41.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	DeconRNASeq_1.41.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DeconRNASeq
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DeconRNASeq
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/DeconRNASeq/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DeconRNASeq/
软件包下载报告	下载数据