DeMixT

DOI:10.18129 / B9.bioc.DeMixT

这是发展DeMixT版本;稳定的发布版本,请参阅DeMixT

细胞特定类型反褶积的异构肿瘤样本与两个或三个组件使用表达式RNAseq或微阵列平台的数据

Bioconductor版本:发展(3.17)

DeMixT软件包,执行反褶积在转录组数据来自两个或三个组件的混合物。

作者:王结雅河边上,< zw17。大米在gmail.com >,曹Shaolong < scao mdanderson.org >, Wenyi王在mdanderson.org < wwang7 >

维护人员:帅郭<帅。郭:uth.tmc.edu >

从内部引用(R,回车引用(“DeMixT”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“DeMixT”)

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文档

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HTML R脚本 DeMixT.Rmd
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文本 新闻

细节

biocViews 分类,报道,GeneExpression,微阵列,测序,软件,StatisticalMethod,TissueMicroarray
版本 1.15.0
Bioconductor自 BioC 3.9 (r - 3.6)(3.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R(> = 3.6.0),并行,Rcpp(> = 1.0.0),SummarizedExperiment,knitr,KernSmooth,matrixcalc,rmarkdown,DSS,dendextend,心理,股东价值分析
进口 matrixStats统计数据,truncdist,base64enc,ggplot2
链接 Rcpp
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 DeMixT_1.15.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64) DeMixT_1.15.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DeMixT
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DeMixT
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/DeMixT/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/DeMixT/
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