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- Bioconductor 3.17
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- DeMixT(开发版)
DeMixT
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DOI:10.18129 / B9.bioc.DeMixT
这是发展DeMixT版本;稳定的发布版本,请参阅DeMixT。
细胞特定类型反褶积的异构肿瘤样本与两个或三个组件使用表达式RNAseq或微阵列平台的数据
Bioconductor版本:发展(3.17)
DeMixT软件包,执行反褶积在转录组数据来自两个或三个组件的混合物。
作者:王结雅河边上,< zw17。大米在gmail.com >,曹Shaolong < scao mdanderson.org >, Wenyi王在mdanderson.org < wwang7 >
维护人员:帅郭<帅。郭:uth.tmc.edu >
从内部引用(R,回车引用(“DeMixT”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“DeMixT”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“DeMixT”)
| HTML | R脚本 | DeMixT.Rmd |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 分类,报道,GeneExpression,微阵列,测序,软件,StatisticalMethod,TissueMicroarray |
| 版本 | 1.15.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.9 (r - 3.6)(3.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R(> = 3.6.0),并行,Rcpp(> = 1.0.0),SummarizedExperiment,knitr,KernSmooth,matrixcalc,rmarkdown,DSS,dendextend,心理,股东价值分析 |
| 进口 | matrixStats统计数据,truncdist,base64enc,ggplot2 |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | DeMixT_1.15.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS二进制(x86_64) | |
| macOS二进制(arm64) | DeMixT_1.15.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DeMixT |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DeMixT |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/DeMixT/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DeMixT/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
