Drimseq

doi：10.18129/b9.bioc.drimseq

这是发展Drimseq的版本;对于稳定版本，请参阅Drimseq。

在RNA-Seq中使用Dirichlet-Multinomial模型进行差分转录用法和TUQTL分析

生物导体版本：开发（3.16）

该软件包提供了两个框架。一种用于不同条件与TUQTL分析之间的差分转录用法分析。两者都是基于建模与迪里奇 - 单胞分布的基因组特征（即转录本）的计数。该软件包还提供了可视化和探索数据和结果的功能。

作者：Malgorzata Nowicka [AUT，CRE]

维护者：malgorzata nowicka

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）＃以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install（version = devel ='devel'）biocmanager :: install（“ drimseq”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

BrowseVignettes（“ Drimseq”）

PDF	R脚本	用DRIMSEQ软件包在RNA-Seq中进行差异笔录的使用和转录用法QTL分析
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	替代方案，，，，差异性，，，，差速器，，，，基因表达，，，，遗传学，，，，免疫学，，，，多重组合，，，，rnaseq，，，，SNP，，，，测序，，，，软件，，，，工作流程
版本	1.25.0
在生物导体中	Bioc 3.3（R-3.3）（6年）
执照	GPL（> = 3）
要看	R（> = 3.4.0）
进口	UTIT，统计，大量的，，，，基因组机，，，，iranges，，，，S4VECTORS，，，，生物基因， 方法，生物比较，，，，林玛，，，，EDGER，，，，GGPLOT2，，，，RESHAPE2
链接
建议	pasillatranscriptexpr，，，，geuvadistranscriptexpr， 网格，生物使用，，，，尼特，，，，测试
系统要求
增强
URL
取决于我	rnaseqdtu
进口我	土匪，，，，同工型间分析仪
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	drimseq_1.25.0.tar.gz
Windows二进制	drimseq_1.25.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	drimseq_1.25.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/drimseq
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/drimseq
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/drimseq/
软件包下载报告	下载统计