剂量

DOI：10.18129 / b9.bioc.dose.

这是发展剂量的版本;对于稳定的版本版本，请参阅剂量。

疾病本体语义和富集分析

Bioconductor版本：开发（3.13）

该包装分别实施了五种方法，分别用于测量术语和基因产品中的语义相似性分别用于测量语义相似性的五种方法。还实施了包括超距离模型和基因集体富集分析的富集分析，用于发现高通量生物数据的疾病关联。

作者：广东yu [AUT，CRE]，LI-GAN王[CTB]，vladislav petyuk [CTB]，Giovanni dall'olio [CTB]，Erqiang Hu [CTB]

维护者：广东宇<广东峪在Gmail.com>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percennamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）＃以下初始化Buoc Devel Biocmanager :: Install（Version ='devel'）BiocManager ::安装（“剂量”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“剂量”）

HTML.	r script.	剂量
PDF.		参考手册
文本		消息

细节

Biocviews.	注解那GenesetenRichment.那多匹匹莫森那途径那软件那可视化
版本	3.17.2
在生物导体中以来	BIOC 2.9（R-2.14）（9.5岁）
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 3.5.0）
进口	annotationdbi.那生物相投那do.db.那FGSEA.那ggplot2.那Gosemsim.（> = 2.0.0），方法，qvalue.那重塑2.，统计，utils
链接到
建议	prettydoc.那ClusterProfiler.那kn那RAMAMAMDOW.那org.hs.eg.db.那testthat.
系统要求
加强
URL.	https://yulab-smu.top/biomedical-knowledge-mining-book//book//
Bugreports.	https://github.com/guangchuangyu/dose/issues.
取决于我
进口我	生物扫描那ClusterProfiler.那德布雷斯勒那EEGC.那纪念碑那gdcrnatools.那网格那Mirsponger.那moonlightr.那反弹那regenrich.那rnaseqr.那SCTERSOR.那签名探索
建议我	可乐那Gosemsim.那魔法杂色那RRVGO.那SCGPS.那simplifyencrice.
链接给我
建立报告

包档案包

跟随bob 体育网址 在r会话中使用此包的说明。

源包	dose_3.17.2.tar.gz.
Windows二进制文件	dose_3.17.2.zip.（32-＆64位）
Macos 10.13（高塞拉）	dose_3.17.2.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/dose.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondudard.org：包装/剂量
包短网址	https://biocumon.org/packages/dose/
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