这是发展DNABARCODES的版本;对于稳定版本,请参阅DNABARCODES。
生物导体版本:开发(3.16)
该软件包提供了一个功能来创建能够纠正插入,删除和替换错误的DNA条形码集。可以分析现有的条形码,以了解其最小,最大和平均条形码之间的条形码。最后,读取以(可能是突变的)条形码开头的读取可以被删除,即分配给其原始参考条形码。
作者:tilo buschmann
维护者:tilo buschmann
引用(从r内,输入引用(“ dnabarcodes”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ dnabarcodes”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ dnabarcodes”)
html | R脚本 | DNABARCODES |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 预处理,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.27.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.2(R-3.2)(6。5年) |
执照 | GPL-2 |
要看 | 矩阵, 平行 |
进口 | RCPP(> = 0.11.2),BH |
链接 | RCPP,,,,BH |
建议 | 尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | DNABARCODECOPATIBLIDIASE |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | dnabarcodes_1.27.0.tar.gz |
Windows二进制 | dnabarcodes_1.27.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | dnabarcodes_1.27.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dnabarcodes |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/dnabarcodes |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/dnabarcodes/ |
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