DNABARCODES

doi:10.18129/b9.bioc.dnabarcodes

这是发展DNABARCODES的版本;对于稳定版本,请参阅DNABARCODES

用于创建和分析下一代测序多路复用实验中使用的DNA条形码的工具

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包提供了一个功能来创建能够纠正插入,删除和替换错误的DNA条形码集。可以分析现有的条形码,以了解其最小,最大和平均条形码之间的条形码。最后,读取以(可能是突变的)条形码开头的读取可以被删除,即分配给其原始参考条形码。

作者:tilo buschmann

维护者:tilo buschmann

引用(从r内,输入引用(“ dnabarcodes”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ dnabarcodes”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ dnabarcodes”)

html R脚本 DNABARCODES
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 预处理,,,,测序,,,,软件
版本 1.27.0
在生物导体中 Bioc 3.2(R-3.2)(6。5年)
执照 GPL-2
要看 矩阵, 平行
进口 RCPP(> = 0.11.2),BH
链接 RCPP,,,,BH
建议 尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我 DNABARCODECOPATIBLIDIASE
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 dnabarcodes_1.27.0.tar.gz
Windows二进制 dnabarcodes_1.27.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) dnabarcodes_1.27.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dnabarcodes
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/dnabarcodes
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/dnabarcodes/
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