- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- DExMA(开发版)
DExMA
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DOI:10.18129 / B9.bioc.DExMA
这是发展DExMA版本;稳定的发布版本,请参阅DExMA。
微分表达式荟萃分析
Bioconductor版本:发展(3.17)
执行的所有步骤的基因表达分析考虑到可能存在的缺失的基因。它提供了必要的功能能够执行不同的基因表达分析的方法。此外,它还含有功能应用质量控制,下载地理数据集和显示结果的图形化表达。
作者:胡安·安东尼奥·Villatoro-Garcia (aut (cre),佩德罗Carmona-Saez (aut)
维护人员:胡安·安东尼奥·Villatoro-Garcia < juanantoniovillatorogarcia gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“DExMA”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“DExMA”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“DExMA”)
| R脚本 | 微分表达式分析DExMA包 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DifferentialExpression,GeneExpression,质量控制,软件,StatisticalMethod |
| 版本 | 1.7.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年) |
| 许可证 | GPL-2 |
| 取决于 | R (> = 4.1),DExMAdata |
| 进口 | Biobase,GEOquery,嫁祸于,limma,pheatmap,plyr,尺度,snpStats,股东价值分析,沼泽、数据、方法、效用,bnstruct,RColorBrewer,grDevices |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,qpdf,BiocGenerics,RUnit |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | DExMA_1.7.0.tar.gz |
| Windows二进制 | DExMA_1.7.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | |
| macOS二进制(arm64) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DExMA |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DExMA |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/DExMA/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
