解读

DOI:10.18129 / B9.bioc.DECIPHER

这是发展版本的解读;稳定的发布版本,请参阅解读

工具进行管理、分析和操纵生物序列

Bioconductor版本:发展(3.17)

一个工具集用于解密和管理生物序列。

作者:埃里克·赖特

维修工:埃里克·赖特在pitt.edu < eswright >

从内部引用(R,回车引用(“破译”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“破译”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“破译”)

PDF R脚本 序列进行分类
PDF R脚本 设计类属特异性的鱼类探测器
PDF R脚本 设计类属特异性的引物
PDF R脚本 设计微阵列探针
PDF R脚本 设计引物,收益率与签名
PDF R脚本 检测模糊串联重复序列
PDF R脚本 发现嵌合序列
PDF R脚本 开始破解
PDF R脚本 系统发育树线与增长
PDF R脚本 多重序列比对R的艺术
PDF R脚本 RNA的双重生活:揭露非编码RNA
PDF R脚本 神奇的基因发现
PDF R脚本 与Clusterize Upsize集群
PDF 参考手册

细节

biocViews 对齐,聚类,DataImport,GenePrediction,遗传学,ImmunoOncology,微阵列,微生物组,质量控制,测序,软件,可视化,WholeGenome,qPCR
版本 2.27.0
Bioconductor自 BioC 2.9 (r - 2.14)(11年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 3.5.0),Biostrings(> = 2.59.1),RSQLite(> = 1.1),统计、并行
进口 方法,DBI,S4Vectors,IRanges,XVector
链接 Biostrings,S4Vectors,IRanges,XVector
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 AssessORF,sangeranalyseR,SynExtend
进口我 AssessORFData,米娅,openPrimeR,scif里面
建议我 MicrobiotaProcess
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 DECIPHER_2.27.0.tar.gz
Windows二进制 DECIPHER_2.27.0.zip
macOS二进制(x86_64) DECIPHER_2.27.0.tgz
macOS二进制(arm64) DECIPHER_2.27.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DECIPHER
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/破译
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/DECIPHER/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/DECIPHER/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网