CytoDx

DOI:10.18129 / B9.bioc.CytoDx

这是发展CytoDx版本;稳定版请参见CytoDx．

无细胞门控的细胞计数数据对临床结果的可靠预测

Bioconductor版本:开发(3.17)

该软件包提供了使用单细胞数据(如流式细胞术数据，RNA单细胞测序数据)预测临床结果的功能，而不需要细胞门控或聚类。

作者:胡自成

维护者:自成胡<自成。胡在ucsf.edu>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("CytoDx")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CytoDx”)

PDF	R脚本	CytoDx简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays，CellBiology，分类，FlowCytometry，ImmunoOncology，回归，软件，StatisticalMethod，生存
版本	1.19.0
在Bioconductor	BioC 3.7 (R-3.5)(4.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.5)
进口	doParallel，dplyr，glmnet，rpart，rpart.plot统计数据,flowCore， grDevices，图形，utils
链接
建议	knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	CytoDx_1.19.0.tar.gz
Windows二进制	CytoDx_1.19.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	CytoDx_1.19.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	CytoDx_1.19.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CytoDx
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CytoDx
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/CytoDx/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CytoDx/
软件包下载报告	下载数据