CopyNumberPlots

DOI:10.18129 / B9.bioc.CopyNumberPlots

这是发展CopyNumberPlots版本;稳定的发布版本,请参阅CopyNumberPlots

使用karyoploteR功能创建人类的阴谋

Bioconductor版本:发展(3.17)

CopyNumberPlots有一组函数扩展karyoploteRs功能创造美丽,可定制的和灵活的情节相关的人类基因组数据。

作者:Bernat凝胶< bgel igtp。猫>和米里亚姆Magallon < mmagallon在igtp.cat >

维护人员:Bernat凝胶< bgel在igtp.cat >

从内部引用(R,回车引用(“CopyNumberPlots”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“CopyNumberPlots”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“CopyNumberPlots”)

HTML R脚本 CopyNumberPlots装饰图案
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews CopyNumberVariation,报道,DNASeq,DataImport,OneChannel,测序,软件,可视化
版本 1.15.0
Bioconductor自 BioC 3.9 (r - 3.6)(3.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.6),karyoploteR
进口 地区,IRanges,Rsamtools,SummarizedExperiment,VariantAnnotation、方法、统计数据GenomeInfoDb,GenomicRanges,cn.mops,rhdf5,跑龙套
链接
建议 BiocStyle,knitr,rmarkdown,panelcn.mops,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19.masked,DNAcopy,testthat
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/bernatgel/CopyNumberPlots
BugReports https://github.com/bernatgel/CopyNumberPlots/issues
取决于我
进口我 CNVfilteR,CNViz
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 CopyNumberPlots_1.15.0.tar.gz
Windows二进制 CopyNumberPlots_1.15.0.zip
macOS二进制(x86_64) CopyNumberPlots_1.15.0.tgz
macOS二进制(arm64) CopyNumberPlots_1.15.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CopyNumberPlots
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CopyNumberPlots
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/CopyNumberPlots/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/CopyNumberPlots/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网