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- Bioconductor 3.17
- 软件包
- ClusterSignificance(开发版)
ClusterSignificance
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DOI:10.18129 / B9.bioc.ClusterSignificance
这是发展ClusterSignificance版本;稳定的发布版本,请参阅ClusterSignificance。
ClusterSignificance包提供了一些工具来评估如果类集群在维数降低数据表示有分离不同交换数据
Bioconductor版本:发展(3.17)
ClusterSignificance包提供了一些工具来评估如果类集群在维数降低数据表示有分离不同交换数据。术语类集群在这里指的是,集群的点代表已知类的数据。这是特别有用的来确定变量的子集,例如基因仅在特定的通路,可以将样本分为建立这些类。ClusterSignificance完成这个,所有的点投影到一维线。集群分离然后得分的概率出现分离是由于机会评估使用排列方法。
作者:杰森t、(aut (cre) Jesper r . Gadin (aut)
维护人员:杰森T、<杰森。、在ki.se >
从内部引用(R,回车引用(“ClusterSignificance”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“ClusterSignificance”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ClusterSignificance”)
| HTML | R脚本 | ClusterSignificance装饰图案 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 分类,聚类,PrincipalComponent,软件,StatisticalMethod |
| 版本 | 1.27.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(6.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.3.0) |
| 进口 | 方法,pracma,princurve(> = 2.0.5),scatterplot3d,RColorBrewergrDevices,图形,跑龙套,统计数据 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,rmarkdown,testthat,BiocStyle,ggplot2,plsgenomics,covr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | https://github.com/jasonserviss/ClusterSignificance/ |
| BugReports | https://github.com/jasonserviss/ClusterSignificance/issues |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | ClusterSignificance_1.27.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ClusterSignificance_1.27.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | ClusterSignificance_1.27.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | ClusterSignificance_1.27.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ClusterSignificance |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ClusterSignificance |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/ClusterSignificance/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ClusterSignificance/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
