- 家
- Bioconductor 3.17
- 软件包
- ClusterJudge(开发版)
ClusterJudge
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DOI:10.18129 / B9.bioc.ClusterJudge
这是发展ClusterJudge版本;稳定的发布版本,请参阅ClusterJudge。
判断质量的集群使用互信息的方法
Bioconductor版本:发展(3.17)
ClusterJudge实现功能,例子和其他软件发布为一个算法通过长臂猿,FD和罗斯FP。这篇文章叫做“判断质量的基因聚类方法使用基因注释”,它出现在基因组研究,12卷,pp1574 - 1581 (2002)。看到包吗?ClusterJudgefor an overview.
作者:阿德里安Pasculescu
维护人员:阿德里安Pasculescu <。在gmail.com pasculescu >
从内部引用(R,回车引用(“ClusterJudge”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“ClusterJudge”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“ClusterJudge”)
| HTML | R脚本 | 装饰图案的标题 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | 聚类,去,GeneExpression,软件,StatisticalMethod |
| 版本 | 1.21.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(5.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R(> = 3.6),统计,跑龙套,图形,infotheo,晶格,latticeExtra,httr,jsonlite |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | yeastExpData,knitr,rmarkdown,devtools,testthat,biomaRt |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | ClusterJudge_1.21.0.tar.gz |
| Windows二进制 | ClusterJudge_1.21.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | ClusterJudge_1.21.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | ClusterJudge_1.21.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ClusterJudge |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ClusterJudge |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/ClusterJudge/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ClusterJudge/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
