ClassifyR

DOI:10.18129 / B9.bioc.ClassifyR

这是发展ClassifyR版本;稳定的发布版本,请参阅ClassifyR。

框架旨在分类问题,应用微分可变性和微分分布测试

Bioconductor版本:发展(3.17)

软件将分类的框架和生存模型evaluatio r .有四个阶段;数据转换、特征选择、模型训练和预测。变量类型和变量的要求顺序是固定的,但专业变量的函数也可以提供。框架包装在一个驱动程序循环反复进行交叉验证方案。函数微分的意思是微分变化,包括微分分布。附加功能可以由用户,通过创建一个接口框架。

作者:达里奥Strbenac (aut (cre),埃利斯帕特里克(aut),微酸的Iyengar (aut),哈里·罗伯逊(aut)安迪Tran (aut),约翰·奥梅罗德(aut),格雷厄姆•曼(aut)吉恩·杨(aut)

维护人员:达里奥Strbenac <达里奥。在sydney.edu.au strbenac >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“ClassifyR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ClassifyR”)

HTML	R脚本	介绍ClassifyR包
HTML	R脚本	开发人员指南
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	分类,软件,生存
版本	3.3.10
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(8.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 4.1.0),泛型、方法、S4Vectors,MultiAssayExperiment,BiocParallel,生存
进口	网格,genefilter跑龙套,dplyr,tidyr,rlang,管理员,ggplot2(> = 3.0.0),ggpubr,reshape2
链接
建议	limma,刨边机,车,Rmixmod,gridExtra(> = 2.0.0),cowplot,BiocStyle,pamr,PoiClaClu,parathyroidSE,knitr,htmltools,gtable,尺度,e1071,rmarkdown,IRanges,robustbase,glmnet,类,randomForestSRC,MatrixModels,xgboost
SystemRequirements
增强了
URL	https://sydneybiox.github.io/ClassifyR/
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ClassifyR_3.3.10.tar.gz
Windows二进制	ClassifyR_3.3.10.zip
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)	ClassifyR_3.3.10.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ClassifyR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ClassifyR
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ClassifyR/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ClassifyR/
包下载报告	下载数据