Citefuse

doi:10.18129/b9.bioc.citefuse

这是发展citefuse的版本;对于稳定版本,请参阅Citefuse

Citefuse:Cite-seq数据的多模式分析

生物导体版本:开发(3.16)

Citefuse Pacakage在预处理到集成分析(包括双重检测,基于网络的模态积分,细胞类型聚类,差异RNA和蛋白质表达分析,ADT评估,配体 - 体-受体相互作用的差异,配体RNA和蛋白质相互作用分析和基于互动网络的分析可视化。

作者:yingxin lin [AUT,CRE],Hani Kim [aut]

维护者:yingxin lin

引用(从r内,输入引用(“ Citefuse”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ citefuse'devel')

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Citefuse”)

html R脚本 Citefuse
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 基因表达,,,,Singlecell,,,,软件
版本 1.9.0
在生物导体中 Bioc 3.11(R-4.0)(2。5年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 4.0)
进口 Singlecellexperiment(> = 1.8.0),总结性特征(> = 1.16.0),矩阵,,,,混音工具,,,,牛仔图,,,,GGPLOT2,,,,栅格, 网格,dbscan,,,,propr,,,,UWOT,,,,RTSNE,,,,S4VECTORS(> = 0.24.0),Igraph,,,,,,,,斯克兰(> = 1.14.6),图形,方法,统计,utils,RESHAPE2,,,,Ggridges,,,,Randomforest,,,,pheatmap,,,,ggraph,grdevices,RHDF5,,,,rlang
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,DT,,,,mclust,,,,评分,,,,博览会,,,,生物使用,,,,pkgdown
系统要求
增强
URL
BugReports https://github.com/sydneybiox/citefuse/issues
取决于我
进口我
建议我 Mudata
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 citefuse_1.9.0.tar.gz
Windows二进制 citefuse_1.9.0.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) citefuse_1.9.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/citefuse
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/citefuse
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/citefuse/
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