这是发展citefuse的版本;对于稳定版本,请参阅Citefuse。
生物导体版本:开发(3.16)
Citefuse Pacakage在预处理到集成分析(包括双重检测,基于网络的模态积分,细胞类型聚类,差异RNA和蛋白质表达分析,ADT评估,配体 - 体-受体相互作用的差异,配体RNA和蛋白质相互作用分析和基于互动网络的分析可视化。
作者:yingxin lin [AUT,CRE],Hani Kim [aut]
维护者:yingxin lin
引用(从r内,输入引用(“ Citefuse”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ citefuse'devel')
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Citefuse”)
html | R脚本 | Citefuse |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 基因表达,,,,Singlecell,,,,软件 |
版本 | 1.9.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.11(R-4.0)(2。5年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | R(> = 4.0) |
进口 | Singlecellexperiment(> = 1.8.0),总结性特征(> = 1.16.0),矩阵,,,,混音工具,,,,牛仔图,,,,GGPLOT2,,,,栅格, 网格,dbscan,,,,propr,,,,UWOT,,,,RTSNE,,,,S4VECTORS(> = 0.24.0),Igraph,,,,秤,,,,斯克兰(> = 1.14.6),图形,方法,统计,utils,RESHAPE2,,,,Ggridges,,,,Randomforest,,,,pheatmap,,,,ggraph,grdevices,RHDF5,,,,rlang |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,DT,,,,mclust,,,,评分,,,,博览会,,,,生物使用,,,,pkgdown |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/sydneybiox/citefuse/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | Mudata |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | citefuse_1.9.0.tar.gz |
Windows二进制 | citefuse_1.9.0.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | citefuse_1.9.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/citefuse |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/citefuse |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/citefuse/ |
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