ChemmineR

DOI:10.18129 / B9.bioc.ChemmineR

这是发展ChemmineR版本;稳定的发布版本,请参阅ChemmineR。

Cheminformatics R的工具包

Bioconductor版本:发展(3.17)

ChemmineR cheminformatics包分析药物类小分子数据在r .其最新版本包含函数有效地处理大量的分子,物理化学/结构性能预测,结构相似性搜索、分类和聚类的化合物库的广泛的算法。此外,它提供了可视化功能复合聚类结果和化学结构。

作者:y埃迪曹,凯文•霍兰泰勒后方,托马斯Girke

维护人员:托马斯Girke <托马斯。在ucr.edu girke >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“ChemmineR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“ChemmineR”)

HTML	R脚本	ChemmineR
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文本		新闻

细节

biocViews	BiomedicalInformatics,CellBasedAssays,Cheminformatics,聚类,DataImport,基础设施,代谢组学,MicrotitrePlateAssay,遗传药理学,药物基因组学,蛋白质组学,软件,可视化
版本	3.51.0
Bioconductor自	BioC 2.3 (r - 2.8)(14.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(> = 2.10.0)方法
进口	rjson、图表、数据、RCurl,DBI,消化,BiocGenerics,Rcpp(> = 0.11.0)它,ggplot2、网格gridExtra,png,base64enc,DT,rsvg,jsonlite,stringi
链接	Rcpp,黑洞
建议	RSQLite,scatterplot3d,gplots,fmcsR,雪,RPostgreSQL,BiocStyle,knitr,knitcitations,knitrBootstrap,ChemmineDrugs,png,rmarkdown,BiocManager,助理
SystemRequirements	GNU使
增强了	ChemmineOB
URL	https://github.com/girke-lab/ChemmineR
取决于我	ChemmineDrugs,eiR,fmcsR
进口我	bioassayR,CompoundDb,customCMPdb,eiR,fmcsR,MetID,RMassBank
建议我	ChemmineOB
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ChemmineR_3.51.0.tar.gz
Windows二进制	ChemmineR_3.51.0.zip
macOS二进制(x86_64)	ChemmineR_3.51.0.tgz
macOS二进制(arm64)	ChemmineR_3.51.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChemmineR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ChemmineR
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ChemmineR/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ChemmineR/
包下载报告	下载数据