ChemmineOB

DOI:10.18129 / B9.bioc.ChemmineOB

这是发展ChemmineOB版本;稳定的发布版本,请参阅ChemmineOB。

R接口OpenBabel功能的一个子集

Bioconductor版本:发展(3.17)

ChemmineOB R提供了一个接口的一个子集cheminformatics功能实现的OpelBabel c++项目。OpenBabel是一个开源cheminformatics工具箱,包括公用事业结构格式互变现象,描述符计算,复合相似性搜索和更多。ChemineOB旨在提供这些实用程序的一个子集在r .对于非开发人员来说,从ChemmineR ChemineOB主要是为了使用一个插件包,而不是直接使用。bob电竞体育官网

作者:凯文·霍兰托马斯Girke

维护人员:托马斯Girke <托马斯。在ucr.edu girke >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“ChemmineOB”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ChemmineOB”)

HTML	R脚本	ChemmineOB
PDF		参考手册
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文本		安装
文本		许可证

细节

biocViews	BiomedicalInformatics,CellBasedAssays,Cheminformatics,聚类,DataImport,基础设施,代谢组学,MicrotitrePlateAssay,遗传药理学,药物基因组学,蛋白质组学,软件,可视化
版本	1.37.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(9.5年)
许可证	文件许可证
取决于	R(> = 2.15.1)方法
进口	BiocGenerics,zlibbioc,Rcpp(> = 0.11.0)它
链接	黑洞,Rcpp,zlibbioc
建议	ChemmineR,BiocStyle,knitr,knitrBootstrap,BiocManager,rmarkdown
SystemRequirements	OpenBabel(> = 3.0.0)头(http://openbabel.org)。Eigen3头。
增强了	ChemmineR(> = 2.13.0)
URL	https://github.com/girke-lab/ChemmineOB
取决于我
进口我	RMassBank
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ChemmineOB_1.37.0.tar.gz
Windows二进制	ChemmineOB_1.37.0.zip
macOS二进制(x86_64)	ChemmineOB_1.37.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChemmineOB
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ChemmineOB
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ChemmineOB/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ChemmineOB/
包下载报告	下载数据