ChIPseeker

DOI:10.18129 / B9.bioc.ChIPseeker

这是发展ChIPseeker版本;稳定的发布版本,请参阅ChIPseeker。

ChIPseeker对芯片峰值注释、比较和可视化

Bioconductor版本:发展(3.14)

这个包实现函数来检索最近的基因在高峰,注释基因组区域的峰值,statstical方法估计芯片之间的重叠峰的数据集的意义,并结合地理数据库对用户比较自己的数据集与存入数据库。比较可以用来推断合作监管,因此可用于生成假设。一些可视化功能实现的报道总结峰实验,平均剖面和热图的山峰绑定TSS地区,基因组注释,距离TSS和重叠峰或基因。

作者:Guangchuang Yu (aut (cre),云颜施,Herve页面(施),迈克尔·克鲁格(施),托马斯Schwarzl[所有],Zhougeng徐(施)

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