ChIPComp

DOI:10.18129 / B9.bioc.ChIPComp

这是发展ChIPComp版本;稳定版请参见ChIPComp．

多个ChIP-seq数据集的定量比较

Bioconductor版本:开发(3.17)

ChIPComp在考虑匹配控制的多种条件下检测差异结合的尖锐结合位点。

作者:吴浩，陈莉，秦朝晖，王驰

维护人员:李晨<李。陈在emory.edu>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("ChIPComp")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ChIPComp”)

PDF	R脚本	ChIPComp
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ChIPSeq，报道，DataImport，遗传学，MultipleComparison，测序，软件，转录
版本	1.29.0
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(7.5年)
许可证	GPL
取决于	R (>= 3.2.0)，GenomicRanges，IRanges，rtracklayer，GenomeInfoDb，S4Vectors
进口	Rsamtools，limma，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19，BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9，BiocGenerics
链接
建议	BiocStyle，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ChIPComp_1.29.0.tar.gz
Windows二进制	ChIPComp_1.29.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	ChIPComp_1.29.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	ChIPComp_1.29.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChIPComp
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ChIPComp
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/ChIPComp/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ChIPComp/
软件包下载报告	下载数据