CellMapper

DOI:10.18129 / B9.bioc.CellMapper

这是发展CellMapper版本;稳定版请参见CellMapper．

预测特定细胞类型中选择性表达的基因

Bioconductor版本:开发(3.16)

基于与已知细胞类型标记基因的共表达相似性推断细胞类型特异性表达。可以使用公开的表达数据进行准确的预测，即使以前没有分离过细胞类型。

作者:Brad Nelms

维护者:Brad Nelms 上搜索

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("CellMapper")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CellMapper”)

PDF	R脚本	CellMapper装饰图案
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，微阵列，软件
版本	1.23.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(6年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	S4Vectors、方法
进口	统计,跑龙套
链接
建议	CellMapperData，Biobase，HumanAffyData，所有，BiocStyle，ExperimentHub
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	CellMapperData
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	CellMapper_1.23.0.tar.gz
Windows二进制	CellMapper_1.23.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	CellMapper_1.23.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	CellMapper_1.23.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CellMapper
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CellMapper
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CellMapper/
软件包下载报告	下载数据