CausalR

DOI:10.18129 / B9.bioc.CausalR

这是发展CausalR版本;稳定版请参见CausalR

因果网络分析方法

Bioconductor版本:开发(3.17)

基于基因组尺度数据的调节因子预测和网络重建的因果网络分析方法。

作者:Glyn Bradley, Steven Barrett, Chirag Mistry, Mark Pipe, David Wille, David Riley, Bhushan Bonde, Peter woolard

维护者:Glyn Bradley < Glyn .x。布拉德利在gsk.com>,史蒂文·巴雷特< Steven .j。巴雷特在gsk.com>

引文(从R内,输入引用(“CausalR”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("CausalR")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“CausalR”)

PDF R脚本 CausalR.pdf
PDF 参考手册

细节

biocViews DifferentialExpressionGraphAndNetworkImmunoOncology微阵列网络网络推理蛋白质组学RNASeq软件SystemsBiology转录组
版本 1.31.0
在Bioconductor BioC 3.2 (R-3.2)(7.5年)
许可证 GPL (>= 2)
取决于 R (>= 3.2.0)
进口 igraph
链接
建议 knitrRUnitBiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 CausalR_1.31.0.tar.gz
Windows二进制 CausalR_1.31.0.zip
macOS二进制文件(x86_64) CausalR_1.31.0.tgz
macOS二进制文件(arm64) CausalR_1.31.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CausalR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CausalR
生物包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/CausalR/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/CausalR/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网