类别

DOI:10.18129 / B9.bioc.Category

这是发展版本的类别;稳定的发布版本,请参阅类别。

类别分析

Bioconductor版本:发展(3.16)

一组工具来执行类别(基因集富集)分析。

作者:罗伯特先生(aut),赛斯猎鹰[所有],Deepayan Sarkar[所有],罗伯特Castelo[所有],Bioconductor包维护者(cre)

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.2”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“类别”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“类别”)

PDF	R脚本	使用类别分析微阵列数据
PDF	R脚本	利用染色体乐队类别
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,去,GeneSetEnrichment,通路,软件
版本	2.63.0
Bioconductor自	BioC 1.6 (r - 2.1)或更早(> 17.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	方法、stats4BiocGenerics,AnnotationDbi,Biobase,矩阵
进口	跑龙套,统计数据,图,RBGL,GSEABase,genefilter,注释,DBI
链接
建议	EBarrays,所有,Rgraphviz,RColorBrewer,xtable(> = 1.4 6),hgu95av2.db,KEGGREST,karyoploteR,geneplotter,limma,晶格,RUnit,org.Sc.sgd.db,GOstats,GO.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	GOstats
进口我	categoryCompare,cellHTS2,GmicR,interactiveDisplay,meshr,miRLAB,phenoTest,ReportingTools,scTensor
建议我	GSEAlm,qpgraph,RnBeads
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Category_2.63.0.tar.gz
Windows二进制	Category_2.63.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	Category_2.63.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Category
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/类别
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Category/
包下载报告	下载数据