CancerInSilico

DOI:10.18129 / B9.bioc.CancerInSilico

这是发展CancerInSilico版本;稳定版请参见CancerInSilico．

肿瘤进展的计算建模的R接口

Bioconductor版本:开发(3.17)

CancerInSilico包提供了一个R接口，用于运行肿瘤进展的数学模型，并根据结果生成基因表达数据。这个包包含用c++实现的底层模型和用R实现的输出和分析特性。

作者:Thomas D. Sherman, Raymond Cheng, Elana J. Fertig

维护者:Thomas D. Sherman ， Elana J. Fertig

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("CancerInSilico")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	BiomedicalInformatics，CellBiology，GeneExpression，ImmunoOncology，MathematicalBiology，RNASeq，SingleCell，软件，SystemsBiology
版本	2.19.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(6.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.4)，Rcpp
进口	方法，utils，图形，统计
链接	Rcpp，黑洞
建议	testthat，knitr，rmarkdown，BiocStyle，Rtsne，冬青，rgl，gplots
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包
Windows二进制	CancerInSilico_2.19.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	CancerInSilico_2.19.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CancerInSilico
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CancerInSilico
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/CancerInSilico/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CancerInSilico/
软件包下载报告	下载数据