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- Bioconductor 3.17
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- CTDquerier(开发版)
CTDquerier
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DOI:10.18129 / B9.bioc.CTDquerier
这个包是Bioconductor的3.17版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅CTDquerier。
包CTDbase数据查询、可视化和下游分析
Bioconductor版本:发展(3.17)
包比较Toxicogenomics从数据库检索和可视化数据(http://ctdbase.org/)。下载的数据格式化为下游DataFrames分析。
作者:Carles Hernandez-Ferrer (aut),胡安·r·冈萨雷斯(aut) Xavier Escriba-Montagut (cre)
维护人员:Xavier Escriba-Montagut < xavier.escriba isglobal.org >
从内部引用(R,回车引用(“CTDquerier”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“CTDquerier”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
| 参考手册 | ||
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | BiomedicalInformatics,DataImport,DataRepresentation,去,GeneSetEnrichment,基础设施,KEGG,网络,NetworkEnrichment,通路,软件 |
| 版本 | 2.7.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.7 (r - 3.5)(5年) |
| 许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 4.1) |
| 进口 | RCurl,stringr,S4Vectors,stringdist,ggplot2,igraph、跑龙套、网格gridExtra、方法、统计数据BiocFileCache |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle,knitr,rmarkdown |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | CTDquerier_2.7.0.tar.gz |
| Windows二进制 | CTDquerier_2.7.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | CTDquerier_2.7.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | CTDquerier_2.7.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CTDquerier |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CTDquerier |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/CTDquerier/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/CTDquerier/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
