CSSQ

doi:10.18129/b9.bioc.cssq

这是发展CSSQ的版本;对于稳定版本,请参阅CSSQ

芯片序列信号量词管道

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包应进行统计分析,以识别多个CHIP-SEQ数据集之间的统计上显着的差异约束区域。

作者:Ashwath Kumar [aut],Michael Y Hu [aut],Yajun Mei [aut],Yuhong fan [aut]

维护者:佐治亚理工学院的粉丝实验室

引用(从r内,输入引用(“ CSSQ”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ CSSSQ”)的用法

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ CSSQ”)

html R脚本 CSSQ简介
PDF 参考手册

细节

生物浏览 chipseq,,,,差异词,,,,正常化,,,,测序,,,,软件
版本 1.9.0
在生物导体中 Bioc 3.11(R-4.0)(2。5年)
执照 艺术2.0
要看 总结性特征,,,,基因组机,,,,iranges,,,,S4VECTORS,,,,rtracklayer
进口 基因组签名,,,,GenomicFeatures,,,,rsamtools,,,,GGPLOT2,grdevices,统计,utils
链接
建议 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,降价
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 cssq_1.9.0.tar.gz
Windows二进制 CSSQ_1.9.0.ZIP(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) CSSQ_1.9.0.TGZ
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cssq
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/cssq
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/cssq/
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