这是发展CSSQ的版本;对于稳定版本,请参阅CSSQ。
生物导体版本:开发(3.16)
该软件包应进行统计分析,以识别多个CHIP-SEQ数据集之间的统计上显着的差异约束区域。
作者:Ashwath Kumar [aut],Michael Y Hu [aut],Yajun Mei [aut],Yuhong fan [aut]
维护者:佐治亚理工学院的粉丝实验室
引用(从r内,输入引用(“ CSSQ”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ CSSSQ”)的用法
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ CSSQ”)
html | R脚本 | CSSQ简介 |
参考手册 |
生物浏览 | chipseq,,,,差异词,,,,正常化,,,,测序,,,,软件 |
版本 | 1.9.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.11(R-4.0)(2。5年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | 总结性特征,,,,基因组机,,,,iranges,,,,S4VECTORS,,,,rtracklayer |
进口 | 基因组签名,,,,GenomicFeatures,,,,rsamtools,,,,GGPLOT2,grdevices,统计,utils |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,降价 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | cssq_1.9.0.tar.gz |
Windows二进制 | CSSQ_1.9.0.ZIP(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | CSSQ_1.9.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cssq |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/cssq |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/cssq/ |
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