cnorfeeder

doi:10.18129/b9.bioc.cnorfeeder

这是发展cnorfeeder的版本;对于稳定版本,请参阅cnorfeeder

集成CellNOPTR以添加缺少链接

生物导体版本:开发(3.16)

该软件包将文献受限和数据驱动的方法集成了从扰动实验推断信号网络。它允许扩展一个给定的网络,该网络具有通过各种推理方法从数据得出的链接,并使用有关蛋白质物理相互作用的信息来指导和验证链接的集成。

作者:Federica Eduati [aut],Enio Gjerga [CTB],Attila Gabor [CRE]

维护者:attila gabor

引用(从r内,输入引用(“ cnorfeeder”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:

if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ cnorfeeder”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“ cnorfeeder”)

PDF R脚本 主要小插图:使用CNORFEEDER使用网络玩
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 蜂窝基,,,,细胞生物学,,,,网络引导,,,,蛋白质组学,,,,软件
版本 1.37.3
在生物导体中 Bioc 2.12(R-3.0)(9年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.6.0),Cellnoptr(> = 1.4.0),图形
进口
链接
建议 模丝,,,,catnet,,,,rgraphviz,,,,运行,,,,生物基因,,,,Igraph
系统要求
增强 Meigor
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 cnorfeeder_1.37.3.tar.gz
Windows二进制 cnorfeeder_1.37.3.zip(仅64位)
MacOS 10.13(高山脉) cnorfeeder_1.37.3.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cnorfeeder
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/cnorfeeder
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/cnorfeeder/
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