这是发展cnorfeeder的版本;对于稳定版本,请参阅cnorfeeder。
生物导体版本:开发(3.16)
该软件包将文献受限和数据驱动的方法集成了从扰动实验推断信号网络。它允许扩展一个给定的网络,该网络具有通过各种推理方法从数据得出的链接,并使用有关蛋白质物理相互作用的信息来指导和验证链接的集成。
作者:Federica Eduati [aut],Enio Gjerga [CTB],Attila Gabor [CRE]
维护者:attila gabor
引用(从r内,输入引用(“ cnorfeeder”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ cnorfeeder”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ cnorfeeder”)
R脚本 | 主要小插图:使用CNORFEEDER使用网络玩 | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 蜂窝基,,,,细胞生物学,,,,网络引导,,,,蛋白质组学,,,,软件 |
版本 | 1.37.3 |
在生物导体中 | Bioc 2.12(R-3.0)(9年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.6.0),Cellnoptr(> = 1.4.0),图形 |
进口 | |
链接 | |
建议 | 模丝,,,,catnet,,,,rgraphviz,,,,运行,,,,生物基因,,,,Igraph |
系统要求 | |
增强 | Meigor |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | cnorfeeder_1.37.3.tar.gz |
Windows二进制 | cnorfeeder_1.37.3.zip(仅64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | cnorfeeder_1.37.3.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cnorfeeder |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/cnorfeeder |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/cnorfeeder/ |
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