这是发展CGHCALL的版本;对于稳定版本,请参阅CGHCALL。
生物导体版本:开发(3.16)
使用六个状态混合模型以及现有算法忽略的几种生物学概念来调用数组CGH数据的畸变。还提供了配置文件的可视化。
作者:马克·范·韦尔(Mark van de Wiel),Sjoerd Vosse
维护者:Mark van de Wiel
引用(从r内,输入引用(“ CGHCALL”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.2”)并输入:
if(!quired(“ Biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ Biocmanager”)#以下初始化Bioc Devel Biocmanager :: install(version = devel ='devel')biocmanager :: install(“ cghcall”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ CGHCALL”)
R脚本 | CGHCALL | |
参考手册 |
生物浏览 | 微阵列,,,,预处理,,,,软件,,,,可视化 |
版本 | 2.59.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.1(R-2.6)(15年) |
执照 | GPL(http://www.gnu.org/copyleft/gpl.html) |
要看 | r(> = 2.0.0),算(> = 1.8.0),DNACOPIGY(> = 1.6.0),方法,生物酶,,,,CGHBASE(> = 1.15.1),降雪 |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | CGHNMALALALALITER,,,,吉恩·布雷克(Genebreak) |
进口我 | CGHNMALALALALITER,,,,QDNASEQ |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | CGHCALL_2.59.0.TAR.GZ |
Windows二进制 | cghcall_2.59.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | CGHCALL_2.59.0.TGZ |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/cghcall |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/cghcall |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/cghcall/ |
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