咖啡馆

DOI:10.18129 / B9.bioc.CAFE

这是发展CAFE版本;稳定版请参见咖啡馆．

表达数据中的染色体畸变查找器

Bioconductor版本:开发(3.17)

使用Affymetrix表达微阵列作为输入，检测和可视化总的染色体畸变

作者:Sander Bollen

维护者:Sander Bollen <桑德。h。Bollen在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.3”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") #初始化使用Bioc devel BiocManager::install(version='devel') BiocManager::install("CAFE")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“咖啡馆”)

PDF	R脚本	手册
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，GeneSetEnrichment，微阵列，OneChannel，软件
版本	1.35.0
在Bioconductor	BioC 2.14 (R-3.1)(9年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 2.10)，biovizBase，GenomicRanges，IRanges，ggbio
进口	affy，ggplot2，注释、网格gridExtratcltk,Biobase
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	CAFE_1.35.0.tar.gz
Windows二进制	CAFE_1.35.0.zip
macOS二进制文件(x86_64)	CAFE_1.35.0.tgz
macOS二进制文件(arm64)	CAFE_1.35.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CAFE
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CAFE
生物包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/CAFE/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CAFE/
软件包下载报告	下载数据