卡昂

DOI:10.18129 / B9.bioc.CAEN

这是发展卡昂的版本;稳定的发布版本,请参阅卡昂

分类编码方法用于选择单细胞RNA-seq的分类特征基因

Bioconductor版本:发展(3.18)

随着高通量技术的发展,越来越多的基因表达分析往往取代hybridization-based微阵列的革命性技术。新方法编码类别再次利用样本的秩为每个基因在每个类。然后我们考虑基因的相关系数和阶级等级的样品和新等级的类别。相关系数最高的基因被认为是最有效的特征基因对样本进行分类。

作者:周燕(aut (cre)

维修工:周燕在email.szu.edu.cn < 2160090406 >

从内部引用(R,回车引用(“卡昂”)):

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“卡昂”)

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细节

biocViews ATACSeq,分类,DifferentialExpression,GeneExpression,RIPSeq,RNASeq,测序,SingleCell,软件
版本 1.9.0
Bioconductor自 BioC 3.13 (r - 4.1)(2年)
许可证 GPL-2
取决于 R (> = 4.1)
进口 PoiClaClu统计数据,SummarizedExperiment、方法
链接
建议 knitr、rmarkdown BiocManager,SummarizedExperiment,BiocStyle
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包档案

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源包 CAEN_1.9.0.tar.gz
Windows二进制 CAEN_1.9.0.zip
macOS二进制(x86_64) CAEN_1.9.0.tgz
macOS二进制(arm64) CAEN_1.9.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CAEN
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/卡昂
Bioc包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/CAEN/
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/CAEN/
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