BumpyMatrix

DOI:10.18129 / B9.bioc.BumpyMatrix

这是发展BumpyMatrix版本;稳定的发布版本,请参阅BumpyMatrix。

种基本对象的崎岖不平的矩阵

Bioconductor版本:发展(3.17)

为持有种基本实现BumpyMatrix类和几个子类对象的每个条目的矩阵。这类似于一个衣衫褴褛的数组但破烂在第三维度,更像一个崎岖不平的表面,因此得名。特别感兴趣的是BumpyDataFrameMatrix,每个条目是一个Bioconductor数据帧。这使我们能够自然地表示多变量数据的格式兼容二维容器SummarizedExperiment和MultiAssayExperiment对象。

作者:亚伦Lun (aut (cre),基因泰克公司(cph)

维护人员:亚伦Lun < infinite.monkeys.with。键盘在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“BumpyMatrix”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“BumpyMatrix”)

HTML	R脚本	BumpyMatrix类
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	DataRepresentation,基础设施,软件
版本	1.7.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(1.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于
进口	跑龙套、方法矩阵,S4Vectors,IRanges
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/BumpyMatrix
BugReports	https://github.com/LTLA/BumpyMatrix/issues
取决于我
进口我	CoreGx,MerfishData,MouseGastrulationData
建议我	ggspavis,SpatialExperiment,STexampleData
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BumpyMatrix_1.7.0.tar.gz
Windows二进制	BumpyMatrix_1.7.0.zip
macOS二进制(x86_64)	BumpyMatrix_1.7.0.tgz
macOS二进制(arm64)	BumpyMatrix_1.7.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BumpyMatrix
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BumpyMatrix
Bioc包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/BumpyMatrix/
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BumpyMatrix/
包下载报告	下载数据