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- Bioconductor 3.17
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- BiocWorkflowTools(开发版)
BiocWorkflowTools
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DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocWorkflowTools
这是发展BiocWorkflowTools版本;稳定的发布版本,请参阅BiocWorkflowTools。
工具来援助Bioconductor工作流软件包的开发
Bioconductor版本:发展(3.17)
提供函数来缓解Rmarkdown之间的过渡和乳胶文档当创作Bioconductor工作流。
作者:迈克·史密斯(aut (cre) Andrzej Oleś(aut)
维护人员:迈克史密斯< grimbough gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“BiocWorkflowTools”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.3”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (BiocManager) #以下初始化使用Bioc猛击BiocManager::安装(version =“重击”)BiocManager::安装(“BiocWorkflowTools”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“BiocWorkflowTools”)
| HTML | R脚本 | 转换Rmarkdown F1000Research乳胶格式 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | ReportWriting,软件 |
| 版本 | 1.25.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(6.5年) |
| 许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 3.4) |
| 进口 | BiocStyle,bookdown,git2r,httr,knitr,rmarkdown,rstudioapi,stringr、工具、跑龙套usethis |
| 链接 | |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | RNAseq123 |
| 进口我 | |
| 建议我 | BiocMetaWorkflow,CAGEWorkflow,recountWorkflow |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | BiocWorkflowTools_1.25.0.tar.gz |
| Windows二进制 | BiocWorkflowTools_1.25.0.zip |
| macOS二进制(x86_64) | BiocWorkflowTools_1.25.0.tgz |
| macOS二进制(arm64) | BiocWorkflowTools_1.25.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocWorkflowTools |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BiocWorkflowTools |
| Bioc包浏览器 | https://code.bioconductor.org/browse/BiocWorkflowTools/ |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BiocWorkflowTools/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
